所管局等：大臣官房

担当課：厚生科学課

• 独立行政法人医薬基盤研究所
• 独立行政法人国立健康・栄養研究所

所管局：健康局

担当課：水道課

• 独立行政法人水資源機構（水路事業部の事業を農林水産省・経済産業省と共に所管する）

所管局：医政局

担当課：国立病院課/国立病院機構管理室

• 独立行政法人国立病院機構

所管局：医薬食品局

担当課：総務課

• 独立行政法人医薬品医療機器総合機構

所管局：労働基準局

担当課：安全衛生部/計画課

• 独立行政法人労働安全衛生総合研究所

担当課：労災補償部/労災管理課

• 独立行政法人労働者健康福祉機構

担当課：勤労者生活部/勤労者生活課

• 独立行政法人勤労者退職金共済機構

所管局：職業安定局

担当課：高齢・障害者雇用対策部/企画課

• 独立行政法人高齢・障害者雇用支援機構

所管局：職業能力開発局

担当課：総務課

• 独立行政法人雇用・能力開発機構

所管局：社会・援護局

担当課：福祉基盤課

• 独立行政法人福祉医療機構

担当課：障害保健福祉部/障害福祉課/施設管理室

• 独立行政法人国立重度知的障害者総合施設のぞみの園

所管局：年金局

担当課：総務課

• 年金積立金管理運用独立行政法人

所管局等：政策統括官

担当課：労政担当参事官室

• 独立行政法人労働政策研究・研修機構

所管局等：社会保険庁

担当課：運営部/企画課/施設整理推進室

• 独立行政法人年金・健康保険福祉施設整理機構